กิจกรรมการค้าผิดกฎหมาย เช่น ยาเสพย์ติด, ขยะอิเล็กทรอนิกส์ และสัตว์ป่าใกล้สูญพันธ์จะถูกกระตุ้นมากขึ้นเมื่อมีการลดอุปสรรคทางการค้าและไม่มีการเพิ่มมาตรการป้องกัน สเตรทไทม์ รายงานว่า ทุกปีจะมีการเคลื่อนย้ายท่อนซุงจำนวนมากที่ผิดกฎหมายในอาเซียน บางส่วนจะไปที่ลาวและกัมพูชา และไม้สักจะถูกขนส่งทั่วชายแดนไปยังเวียดนาม และถูกเปลี่ยนเป็นเฟอร์นิเจอร์ หลังจากนั้นจะถูกขายต่อไปยังประเทศจีน ทั้งนี้เจ้าหน้าที่บังคับกฎหมายต้องเจอกับความยากลำบากในการติดตามไม้สักและสินค้าที่เกี่ยวข้อง ซึ่งถูกประเมินว่ามีมูลค่าประมาณ 11,000 ล้านดอลลาร์สหรัฐในปี 2553 ผู้เชี่ยวชาญได้กล่าวเตือนว่า เจ้าหน้าที่ต้องเจอความยากยิ่งขึ้นไปอีกเมื่อพิธีการศุลกากรถูกทำให้มีประสิทธิภาพมากขึ้นในหมู่ประเทศสมาชิกอาเซียนภายใต้แผนการรวมกลุ่มทางเศรษฐกิจ ซึ่งจะเริ่มในปลายปีหน้า โดยผู้เชี่ยวชาญจากสำนักงานป้องกันยาเสพติดและปราบปรามอาชญากรรมแห่งสหประชาชาติ (UNODC) กล่าวว่า กิจกรรมการค้าผิดกฎหมาย เช่น ยาเสพย์ติด, ขยะอิเล็กทรอนิกส์, การค้ามนุษย์ และสัตว์ป่าใกล้สูญพันธุ์ จะถูกกระตุ้นมากขึ้นเมื่อมีการลดอุปสรรคทางการค้าและไม่มีการเพิ่มมาตรการป้องกัน จิโอวานี โบรวซาด (Giovanni Broussard) เจ้าหน้าที่ของยูเอ็นโอดีซีที่รับผิดชอบทางด้านอาชญากรรมทางสัตว์ป่าและป่าไม้ กล่าวถึงกรณีที่ AEC จะสนับสนุนการค้านั้น ไม่ใช่สถานการณ์ที่ได้ประโยชน์กันทุกฝ่าย และมีด้านมืดต่อการเติบโต และด้านมืดนี้ต้องถูกนำมาพิจารณาเวลาจะสร้างโครงสร้างพื้นฐาน โดยความเสี่ยงในการเพิ่มแรงกดดันให้มีการเคลื่อนไหวที่รวดเร็วของคาร์โก้ผ่านชายแดนคือจะทำให้การบังคับกฎเกณฑ์ที่มีอยู่เป็นไปอย่างหละหลวม